Între secolele XII și XIX, Japonia feudală a avut un sistem elaborat de clase cu patru niveluri. Spre deosebire de societatea feudală europeană, în care țăranii (sau iobagi) se aflau în partea de jos, structura clasei feudale japoneze a plasat comercianții pe treapta cea mai joasă. Idealurile confuciene subliniau importanța productivității, astfel fermierii și pescarii aveau un statut mai ridicat decât cei care păstrează magazinele din Japonia, iar clasa samurai avea cel mai mult prestigiu dintre toți.
Societatea japoneză feudală avea niște ninja celebri și era dominată de clasa războinică samurai. Deși au constituit doar aproximativ 10 la sută din populație, samuraii și domnii lor daimyo aveau o putere enormă.
Când un samurai a trecut, membrii claselor inferioare au fost obligați să se plece și să arate respect. Dacă un fermier sau un artizan refuzau să se închină, samuraiul avea dreptul legal să taie capul persoanei recalcitrante.
Samurai a răspuns numai la daimyo pentru care lucrau. Daimyo, la rândul său, a răspuns numai la shogun. La sfârșitul erei feudale au existat aproximativ 260 de daimyo. Fiecare daimyo controla o suprafață largă de pământ și avea o armată de samurai.
Chiar sub samuraii de pe scara socială erau fermierii și țăranii. Conform idealurilor confuciene, fermierii erau superiori artizanilor și comercianților, deoarece produceau mâncarea de care depindeau toate celelalte clase. Deși tehnic erau considerați o clasă onorată, fermierii au trăit sub o povară impozantă zdrobitoare pentru o mare parte a erei feudale.
În timpul domniei celui de-al treilea shogun Tokugawa, Iemitsu, fermierii nu aveau voie să mănânce niciunul din orezul cultivat. Au fost nevoiți să-i predea daimyo-ului lor și apoi să aștepte ca el să-i dea unele înapoi ca caritate.
Deși artizanii produceau multe bunuri frumoase și necesare, cum ar fi haine, ustensile de gătit și imprimeuri cu blocuri de lemn, acestea erau considerate mai puțin importante decât fermierii. Chiar și producătorii calificați de sabie de samurai și navele de barcă au aparținut acestui al treilea nivel al societății din Japonia feudală.
Clasa artizană trăia în propria secțiune a marilor orașe, separată de samurai (care locuiau de obicei în castelele lui Daimyos) și de clasa inferioară de comercianți.
Nivelul de jos al societății feudale japoneze a fost ocupat de comercianți, care au inclus atât comercianți călători, cât și negustori. Comercianții au fost adesea ostracizați ca „paraziți” care au profitat de forța de muncă a țăranului și a claselor artizanale mai productive. Nu numai că comercianții locuiau într-o secțiune separată a fiecărui oraș, dar claselor superioare le era interzis să se amestece cu ei, cu excepția cazului în care desfășurau afaceri.
Cu toate acestea, multe familii de comercianți au putut să adune averi mari. Pe măsură ce puterea lor economică a crescut, la fel și influența lor politică și restricțiile împotriva acestora au slăbit.
Deși se spune că Japonia feudală a avut un sistem social cu patru niveluri, unii japonezi trăiau deasupra sistemului, iar unii mai jos.
Chiar în culmea societății se afla shogunul, conducătorul militar. El a fost, în general, cel mai puternic daimyo; când familia Tokugawa a preluat puterea în 1603, shogunatul a devenit ereditar. Tokugawa a domnit 15 generații până în 1868.
Deși shogunii au condus spectacolul, ei au condus în numele împăratului. Împăratul, familia sa și nobilimea de curte aveau puteri reduse, dar erau cel puțin nominal deasupra shogunului și, de asemenea, deasupra sistemului cu patru niveluri.
Împăratul a servit ca o figură pentru shogun și ca lider religios al Japoniei. Preoții și călugării budiști și șintoți au fost de asemenea peste sistemul cu patru niveluri.