La 20 de ani, în 1520, Charles V stăpânea cea mai mare colecție de pământ european de la Charlemagne cu peste 700 de ani mai devreme. Charles a fost Ducele de Burgundia, rege al Imperiului Spaniol și teritoriile Habsburgilor, care includea Austria și Ungaria, precum și Sfântul Împărat Roman; a continuat să achiziționeze mai multe terenuri de-a lungul vieții. Problematic pentru Charles, dar interesant pentru istorici, el a achiziționat aceste terenuri fragmentare - nu exista o moștenire unică - și multe dintre teritorii erau țări independente, cu propriile sisteme de guvernare și cu un interes comun comun. Acest imperiu sau Monarchia, poate că i-a adus puterea lui Charles, dar i-a provocat, de asemenea, mari probleme.
Charles a moștenit Imperiul Spaniol în 1516; aceasta a inclus Spania peninsulară, Napoli, mai multe insule din Mediterana și întinderi mari ale Americii. Deși Charles avea un drept clar de moștenire, maniera în care a făcut acest lucru a provocat supărare: în 1516 Charles a devenit regent al Imperiului spaniol în numele mamei sale bolnave mintale. La doar câteva luni, cu mama sa încă în viață, Charles s-a declarat rege.
Modul de urcare a lui Charles pe tron a provocat supărare, unii spanioli dorind ca mama sa să rămână la putere; alții îl susțineau pe moșul mic al lui Charles ca moștenitor. Pe de altă parte, au fost mulți care au participat la curtea noului rege. Charles a cauzat mai multe probleme în maniera în care el a guvernat inițial regatul: unii se temeau că nu are experiență, iar unii spanioli se temeau că Charles se va concentra pe celelalte meleaguri ale sale, cum ar fi cele pe care stătea să le moștenească de la Sfântul Împărat Roman Maximilian. Aceste temeri s-au agravat de perioada în care Charles a lăsat deoparte celelalte afaceri și a călătorit în Spania pentru prima dată: optsprezece luni.
Charles a cauzat alte probleme, mult mai tangibile, când a sosit în 1517. El a promis unei adunări de orașe numite Cortes că nu va numi străini în funcții importante; apoi a emis scrisori prin care naturalizează anumiți străini și i-a numit în funcții importante. Mai mult, după ce Cortes din Castilia a primit o subvenție mare coroanei în 1517, Charles a încetat tradiția și a cerut o altă plată mare, în timp ce prima era plătită. Până acum, petrecuse puțin timp în Castilia, iar banii erau pentru a-și finanța cererea către Sfântul tron roman, o aventură străină temută de castilieni. Acest lucru și slăbiciunea lui când a fost vorba de soluționarea conflictelor interne dintre orașe și nobili, au provocat o mare supărare.
În anii 1520 - 21, Spania a cunoscut o mare revoltă în regatul său castelian, o revoltă care a fost descrisă drept „cea mai mare revoltă urbană din Europa modernă timpurie”. (Bonney, Statele dinastice europene, Longman, 1991, p. 414) Deși este adevărată, această afirmație ascunde o componentă rurală ulterioară, dar încă semnificativă, rurală. Există încă dezbateri cu privire la cât de aproape a reușit revolta, dar această revoltă a orașelor din Castilia - care au format propriile consilii locale sau „comune” - a inclus un adevărat mix de gestionare greșită contemporană, rivalitate istorică și interes politic de sine. Charles nu a fost complet de vină, întrucât presiunea crescuse în ultima jumătate de secol, când orașele se simțeau că pierd din ce în ce mai mult puterea în raport cu nobilimea și coroana.
Revoltele împotriva lui Charles începuseră înainte să plece chiar din Spania în 1520, iar pe măsură ce revoltele s-au răspândit, orașele au început să respingă guvernul său și să-și formeze propriul: consilii numite comuneros. În iunie 1520, când nobilii au rămas liniștiți, sperând să profite de haos, comuneros s-au întâlnit și s-au format împreună în Santa Junta (Liga Sfântă). Regentul lui Charles a trimis o armată să se ocupe de rebeliune, dar aceasta a pierdut războiul de propagandă când a pornit un incendiu care a stârnit Medina del Campo. Mai multe orașe s-au alăturat apoi Santa Junta.
Pe măsură ce răzvrătirea s-a extins în nordul Spaniei, Santa Junta a încercat inițial să o ajute pe mama lui Charles V, vechea regină, de partea lor pentru sprijin. Când aceasta a eșuat, Santa Junta a trimis o listă de cereri lui Charles, listă menită să-l țină rege și să-și modereze acțiunile și să-l facă mai spaniol. Cerințele includeau Charles să se întoarcă în Spania și să le ofere Cortelor un rol mult mai mare în guvernare.
Pe măsură ce răzvrătirea a crescut, au apărut fisuri în alianța orașelor, deoarece fiecare avea propria lor agendă. De asemenea, a început să se spună presiunea furnizării trupelor. Rebeliunea s-a răspândit în mediul rural, unde oamenii și-au îndreptat violența împotriva nobilimii, precum și a regelui. Aceasta a fost o greșeală, deoarece nobilii care s-au mulțumit să lase revolta să continue acum au reacționat împotriva noii amenințări. Nobilii care l-au exploatat pe Charles să negocieze o așezare și o armată condusă de nobili, care a zdrobit comuneros în luptă.
Revolta s-a terminat efectiv după ce Santa Junta a fost învinsă în luptă la Villalar în aprilie 1521, deși buzunarele au rămas până la începutul anului 1522. Reacția lui Charles nu a fost aspră având în vedere standardele zilei, iar orașele și-au păstrat multe dintre privilegiile lor. Cu toate acestea, Cortes nu a câștigat niciodată nicio altă putere și a devenit o bancă glorificată pentru rege.
Charles s-a confruntat cu o altă rebeliune care a avut loc în același timp cu Revolta Comunero, într-o regiune mai mică și mai puțin importantă din punct de vedere financiar din Spania. Aceasta a fost Germania, născută dintr-o miliție creată pentru a lupta împotriva piraților Barbary, un consiliu care dorea să creeze o Veneție precum orașul-stat și mânia de clasă la fel de mult ca o neplăcere a lui Charles. Rebeliunea a fost zdrobită de nobilime fără prea mult ajutor la coroană.
Charles s-a întors în Spania în 1522 pentru a găsi puterea regală restabilită. În următorii ani, a lucrat pentru a schimba relația dintre el și spanioli, învățând limba spaniolă, căsătorindu-se cu o femeie iberică și numind Spania inima imperiului său. Orașele erau înclinate și puteau fi amintite de ceea ce făcuseră dacă se opuneau vreodată lui Charles, iar nobilii se luptaseră în direcția unei relații mai strânse cu el.