O perlă naturală este formată dintr-un moluscă - un animal, cum ar fi o stridie, scoică, conch sau gastropod.
Perlele se formează atunci când un iritant, cum ar fi un pic de mâncare, un grăunte de nisip sau chiar o bucată din manta de moluscă devine prinsă în moluscă. Pentru a se proteja, moluscul secretă substanțe pe care le folosește și pentru a-și construi cochilia - aragonita (un mineral) și conchiolina (o proteină). Aceste substanțe sunt secretate în straturi și se formează o perlă.
În funcție de modul în care se formează aragonitul, perla poate avea un luciu ridicat (nară sau matcă) sau o suprafață mai asemănătoare cu porțelanul.
O perlă sălbatică are adesea imperfecțiuni. O modalitate de a spune o perlă naturală dintr-o perlă artificială, potrivit Muzeului American de Istorie Naturală, este să o freci de dinți. O perlă naturală se va simți cruntă, iar o perlă artificială se va simți netedă.
Perlele create în sălbăticie sunt rare și scumpe. În cele din urmă, oamenii au început să cultive perle, ceea ce implică plasarea unui iritant în scoicile moluștelor. Acestea sunt apoi așezate în coșuri și perla se recoltează după aproximativ 2 ani.
Orice moluște poate forma o perlă, deși sunt mai frecvente la unele animale decât la altele. Există animale cunoscute sub numele de stridii de perle, care include specii din gen Pinctada. Speciile Pinctada maxima (numită stridie de perle cu lipie de aur sau stridie de perle lipite de argint) trăiește în Oceanul Indian și Pacific din Japonia până în Australia și produce perle cunoscute sub numele de Perle de la Marea de Sud. Alte animale producătoare de perle includ abalone, conchs, coajă de stilou și foame. Perlele pot fi, de asemenea, găsite și cultivate în moluște de apă dulce și sunt adesea produse de specii numite colectiv „midii de perle”.