Doi termeni obișnuiți folosiți în știința evoluției sunt omologie și homoplasy.Deși acești termeni sună similari (și au într-adevăr un element lingvistic comun), ei sunt cu totul diferiți în sensurile lor științifice. Ambii termeni se referă la seturi de caracteristici biologice care sunt împărțite de două sau mai multe specii (de aici și prefixul homosexual), dar un termen indică faptul că caracteristica comună provenea de la o specie strămoșă comună, în timp ce celălalt termen se referă la o caracteristică comună care a evoluat independent în fiecare specie.
Termenul de omologie se referă la structuri sau caracteristici biologice care sunt similare sau identice. Aceste caracteristici se găsesc pe două sau mai multe specii diferite atunci când aceste caracteristici pot fi urmărite de un strămoș comun. Un exemplu de omologie este văzut în primele limbi ale broaștelor, păsărilor, iepurilor și șopârlelor. Deși aceste membre au un aspect diferit la fiecare specie, toate au același set de oase. Aceeași dispunere a oaselor a fost identificată în fosilele unei specii foarte vechi dispărute, Eusthenopteron, care a fost moștenită de broaște, păsări, iepuri și șopârlă.
Omoplazia, pe de altă parte, descrie o structură biologică sau o caracteristică pe care două sau mai multe specii diferite au în comun care nu a fost moștenită de la un strămoș comun. O omoplazie evoluează independent, de obicei datorită selecției naturale în medii similare sau umplând același tip de nișă ca și celelalte specii care au și această trăsătură. Un exemplu comun adesea citat este ochiul, care s-a dezvoltat independent în multe specii diferite.
Homologia este un produs al unei evoluții divergente. Aceasta înseamnă că o singură specie strămoșă s-a împărțit sau se diverge în două sau mai multe specii la un moment dat în istoria sa. Aceasta se întâmplă datorită unui anumit tip de selecție naturală sau izolării mediului care separă noua specie de strămoș. Speciile divergente încep acum să evolueze separat, dar păstrează în continuare unele dintre caracteristicile strămoșului comun. Aceste caracteristici ancestrale partajate sunt cunoscute sub numele de omologii.
Omoplazia, pe de altă parte, se datorează evoluției convergente. Aici, diferite specii dezvoltă, mai degrabă decât moștenesc, trăsături similare. Acest lucru se poate întâmpla pentru că speciile trăiesc în medii similare, umplând nișe similare sau prin procesul de selecție naturală. Un exemplu de selecție naturală convergentă este atunci când o specie evoluează pentru a imita aspectul alteia, cum ar fi atunci când o specie non-otrăvitoare dezvoltă marcaje similare cu o specie extrem de veninoasă. O astfel de mimică oferă un avantaj distinct prin descurajarea potențialilor prădători. Marcajele similare împărtășite de rețeaua stacojie (o specie inofensivă) și șarpele de coral mortal este un exemplu de evoluție convergentă.
Omologia și omoplazia sunt adesea dificil de identificat, deoarece ambele pot fi prezente în aceeași caracteristică fizică. Aripa păsărilor și liliecilor este un exemplu în care sunt prezente atât omologia, cât și omoplazia. Oasele din aripi sunt structuri omologe care sunt moștenite de la un strămoș comun. Toate aripile includ un tip de sân, un os mare al brațului superior, două oase ale antebrațului și ceea ce ar fi oase ale mâinii. Această structură osoasă de bază se găsește la multe specii, inclusiv la oameni, ceea ce duce la concluzia corectă că păsările, liliecii, oamenii și multe alte specii au un strămoș comun.
Dar aripile în sine sunt homoplazii, deoarece multe dintre speciile cu această structură osoasă comună, inclusiv oamenii, nu au aripi. De la strămoșul comun cu o anumită structură osoasă, selecția naturală a dus în cele din urmă la dezvoltarea păsărilor și liliecilor cu aripi care le-au permis să umple o nișă și să supraviețuiască într-un anumit mediu. Între timp, alte specii divergente au dezvoltat în cele din urmă degetele și degetele necesare pentru a ocupa o nișă diferită.