Justin era nepotul împăratului Justinian: fiul sorei lui Iustinian, Vigilantia. Ca membru al familiei imperiale, a primit o educație minuțioasă și s-a bucurat de beneficii considerabile care nu erau disponibile pentru cetățenii mai mici ai Imperiului Roman de Răsărit. Poziția sa puternică poate fi motivul pentru care era posedat de o încredere de sine extremă care putea fi și era adesea privită ca o aroganță.
Iustinian nu avea copii de-ai lui, așa că era de așteptat ca unul dintre fiii și nepoții fraților împăratului să moștenească coroana. Justin, la fel ca mai mulți dintre verișorii săi, avea o întreagă de susținători atât în interiorul, cât și în afara palatului. Până în momentul în care Justinian se apropia de sfârșitul vieții sale, doar un alt concurent avea vreo șansă reală de a reuși împăratul: fiul vărului lui Germanus, Germanus, numit și Justin. Acest alt Iustin, un om cu o abilitate militară considerabilă, este considerat de unii istorici ca fiind un candidat mai bun pentru funcția de conducător. Din nefericire pentru el, amintirea nostalgică a împăratului despre regretata sa soție Theodora ar fi putut să-i fi afectat șansele.
Împăratul este binecunoscut că s-a bazat foarte mult pe îndrumările soției sale, iar influența lui Theodora poate fi văzută clar în unele dintre legile pe care Justinian le-a trecut. Este posibil ca neplăcerea ei personală față de Germanus să-l împiedice pe soțul ei să formeze vreun atașament grav cu copiii lui Germanus, a inclus Justin. Mai mult, viitorul împărat Justin al II-lea a fost căsătorit cu nepoata lui Theodora Sophia. Prin urmare, este posibil ca Justinian să aibă sentimente mai calde pentru omul care avea să-i succede. Și, într-adevăr, împăratul l-a numit pe nepotul său Justin la biroul din cura palatii. Această funcție fusese de obicei deținută de un individ cu rangul de spectabilis, care vedea problemele generale ale afacerii zilnice la palat, dar după ce Justin a fost nominalizat, titlul a fost de obicei acordat membrilor familiei imperiale sau, ocazional, prinți străini..
Mai mult, când Justinian a murit, celălalt Iustin păzea frontiera Dunării în rolul său de Maestru al Soldaților din Illyricum. Viitorul împărat se afla la Constantinopol, gata să profite de orice ocazie.
Această ocazie a venit odată cu moartea neașteptată a lui Justinian.
Este posibil ca Justinian să fi fost conștient de mortalitatea sa, dar nu a făcut nicio prevedere pentru un succesor. A murit brusc în noaptea de 14/15 noiembrie 565, nefiind niciodată numit oficial cine avea să-și ia coroana. Acest lucru nu i-a împiedicat pe susținătorii lui Justin să-l manevreze pe tron. Deși, probabil, Iustinian a murit în somn, cămărușul Callinicus a susținut că împăratul l-a desemnat pe fiul lui Vigilantia drept moștenitor cu respirația muribundă.
În primele ore de dimineață ale zilei de 15 noiembrie, camerul și un grup de senatori care au fost treziți din mahalaua lor s-au repezit la palatul lui Justin, unde au fost întâmpinați de Justin și de mama sa. Callinicus a legat dorința morții împăratului și, deși a dat dovadă de reticență, Justin a acceptat rapid cererea senatorilor de a lua coroana. Escortați de senatori, Justin și Sophia s-au îndreptat spre Marele Palat, unde Excubenții au blocat ușile, iar patriarhul l-a încoronat pe Justin. Înainte ca restul orașului să știe chiar că Iustinian era mort, ei aveau un nou împărat.
Dimineața, Justin a apărut în cutia imperială de la Hipodrom, unde s-a adresat oamenilor. A doua zi și-a încoronat soția Augusta. Și, peste câteva săptămâni, celălalt Justin a fost asasinat. Deși cei mai mulți oameni ai zilei au învinuit-o pe Sophia, nu există nici o îndoială că însuși noul împărat se afla în spatele crimei.
Iustin a început apoi să lucreze pentru a câștiga sprijinul populației.
Justinian părăsise imperiul în dificultate financiară. Justin a plătit datoriile predecesorului său, a remis impozitele restante și a redus cheltuielile. De asemenea, el a restabilit consula care a decedat în 541. Toate acestea au ajutat economia locală, care a obținut note mari ale lui Justin de la nobilime și populația generală.
Dar în Constantinopol lucrurile nu au fost înrădăcinate. În cel de-al doilea an al domniei lui Justin, a avut loc o conspirație, posibil motivată de uciderea politică a celuilalt Iustin. Senatorii Aetherios și Addaios au complotat în mod evident pentru a otrăvi noul împărat. Aetherios a mărturisit, numindu-l pe Addaeus drept complice, și amândoi au fost executați. Lucrurile au rulat considerabil după aceea.
Schisma Acaciană care a despărțit Biserica la sfârșitul secolului al V-lea și începutul secolului al VI-lea nu s-a încheiat cu o abolire a filozofiei eretice care a declanșat scindarea. Bisericile monofizite crescuseră și deveniseră înrădăcinate în Imperiul Roman de Răsărit. Theodora fusese un monofizit ferm, iar pe măsură ce Justinian a îmbătrânit, a devenit tot mai înclinat spre filozofia eretică.
Inițial, Iustin a arătat o toleranță religioasă destul de liberală. El a eliberat oameni din biserică monofiziți și a permis episcopilor exilați să vină acasă. Se pare că Justin a dorit să unească facțiunile monofizite disparate și, în cele din urmă, să reunească secta eretică cu punctul de vedere ortodox (așa cum s-a exprimat la Consiliul de la Calcedon). Din păcate, fiecare încercare pe care a făcut-o pentru a facilita concordia a fost întâmpinată cu refuzul extremistilor monofiziți intransigenți. În cele din urmă, toleranța sa s-a transformat în încăpățânarea proprie și a instituit o politică de persecuție care a durat atât timp cât el a fost în controlul imperiului.
Justinian a urmărit o varietate de metode pentru a construi, întreține și păstra pământurile bizantine și a reușit să dobândească un teritoriu din Italia și sudul Europei care făcuse parte din vechiul Imperiu Roman. Justin era hotărât să distrugă dușmanii imperiului și nu dorea să facă compromisuri. La mult timp după ce a obținut tronul, a primit emisari de la avari și le-a refuzat subvențiile pe care unchiul său le acordase. Apoi a format o alianță cu turcii occidentali din Asia Centrală, cu care a luptat împotriva avarilor și, eventual, cu persii..