În august 1863, armata Statelor Unite a început construcția închisorii Rock Island. Situată pe o insulă între Davenport, Iowa și Rock Island, Illinois, închisoarea a fost proiectată pentru a adăposti soldați ai Armatei Confederare capturate. Planul era să construiască 84 de cazărmi cu fiecare locuință de 120 de prizonieri împreună cu propria bucătărie. Gardul de rezerve era înalt de 12 metri. Există o santinelă pusă la fiecare o sută de metri, cu doar două deschideri pentru a intra înăuntru. Închisoarea urma să fie construită pe 12 acri din cei 946 acri care cuprindeau insula.
În decembrie 1863, închisoarea Rock Island, încă neterminată, a primit primii săi prizonieri care au fost prinși de trupele generalului Ulysses S. Grant în timpul bătăliei din Muntele Lookout, din Chattanooga, Tennessee. În timp ce primul grup număra 468, până la sfârșitul lunii, populația din închisori ar depăși 5000 de soldați confederați capturați, unii dintre ei fiind și ei capturați la Bătălia de la Misionarul Ridge, Tennessee.
Temperaturile au fost sub zero grade Fahrenheit în decembrie 1963 când au sosit primii prizonieri. Temperatura va fi raportată la cel mult treizeci și două de grade sub zero uneori în timpul restului primei ierni.
Întrucât construcția închisorii nu a fost finalizată la sosirea primului prizonier confederat, sănătatea și boala, în special un focar de variolă, au fost probleme în acea perioadă. Ca răspuns, în primăvara anului 1864, armata Uniunii a construit un spital și a instalat un sistem de canalizare care a contribuit la îmbunătățirea condițiilor din interiorul zidurilor închisorii, precum și la încheierea epidemiei de variolă.
În iunie 1864, închisoarea Rock Island a schimbat puternic cantitatea de rațiuni primite de prizonieri din cauza felului în care închisoarea Andersonville tratează soldații Armatei Unirii care erau prizonieri. Această schimbare a rațiunilor a avut drept consecință atât malnutriție cât și infarct, ceea ce a dus la moartea prizonierilor confederați la unitatea de închisoare Rock Island..
În perioada în care Insula Rock a funcționat, a găzduit peste 12.000 de soldați confederați din care aproape 2000 au murit, dar deși mulți susțin că Insula Rock a fost comparabilă cu închisoarea Andersonville a confederatiei din punct de vedere inuman, doar șaptesprezece la sută dintre prizonieri au murit, comparativ cu douăzeci -seize la suta din totalul populatiei Andersonville. În plus, Insula Rock a închis cazărmi în raport cu corturile artificiale sau fiind în totalitate în elemente, cum a fost cazul în Andersonville.
Un număr de patruzeci și unu de prizonieri au scăpat și nu au fost recapturați. Una dintre cele mai mari scăpări a avut loc în iunie 1864, când mai mulți prizonieri și-au tunelat ieșirea. Ultimii doi au fost prinși când au ieșit din tunel și alți trei au fost prinși în timp ce încă se aflau pe insulă. Un evadat s-a înecat în timp ce înota peste râul Mississippi, dar alți șase au reușit să-l facă peste. În câteva zile, patru dintre acestea au fost re-capturate de forțele Uniunii, dar două au reușit să eludeze complet capturarea.
Închisoarea Rock Island s-a închis în iulie 1865, iar închisoarea a fost distrusă la scurt timp după aceea. În 1862, Congresul Statelor Unite a înființat un arsenal pe Insula Rock și astăzi este cel mai mare arsenal operat de guvernul țării noastre, care cuprinde aproape întreaga insulă. Acum se numește Insula Arsenal.
Singura dovadă care a rămas că a existat o închisoare care a ținut soldați confederați în timpul Războiului Civil este Cimitirul Confederat, unde sunt înmormântați aproximativ 1950 de prizonieri. În plus, Cimitirul Național Rock Island este, de asemenea, situat pe insulă, unde sunt îngropate resturi de cel puțin 150 de paznici ai Uniunii, precum și peste 18.000 de soldați ai Uniunii.