Între 1946 și 1952, guvernul Filipinelor a luptat împotriva unui inamic tenace numit Hukbalahap sau Huk (pronunțat aproximativ ca „cârlig”). Armata de gherilă și-a luat numele dintr-o contracție a expresiei taggiene Hukbo de la Bayan Balan sau Hapon, adică „Armata anti-japoneză”. Mulți dintre luptătorii de gherilă au luptat ca insurgenți împotriva ocupației japoneze din Filipine între 1941 și 1945. Unii au fost chiar supraviețuitori ai Marșului Morții din Bataan, care au reușit să scape de capturații lor.
Odată terminat al doilea război mondial și japonezii s-au retras, Huk a urmărit o cauză diferită: lupta pentru drepturile fermierilor chiriași împotriva proprietarilor înstăriți de terenuri. Liderul lor era Luis Taruc, care luptase genial împotriva japonezilor din Luzon, cea mai mare dintre insulele Filipine. Până în 1945, gherilele lui Taruc au preluat cea mai mare parte a lui Luzon din armata imperială japoneză, un rezultat foarte impresionant.
Taruc și-a început campania de gherilă de răsturnare a guvernului filipinez după ce a fost ales la Congres în aprilie 1946, dar i s-a refuzat un loc sub acuzația de fraudă electorală și terorism. El și urmașii săi au mers pe dealuri și s-au redenumit Armata de Eliberare a Poporului (PLA). Taruc plănuia să creeze un guvern comunist cu sine însuși președinte. El a recrutat noi soldați de gherilă din organizații de chiriași înființați pentru a reprezenta țărani săraci care erau exploatați de proprietarii lor.
În 1949, membrii PLA au ambuscadat și au ucis-o pe Aurora Quezon, care era văduva fostului președinte filipinez Manuel Quezon și șeful Crucii Roșii Filipine. A fost împușcată mort împreună cu fiica cea mai mare și ginerele ei. Această ucidere a unei persoane publice foarte cunoscute pentru munca ei umanitară și bunătatea personală a transformat numeroși potențiali recruți împotriva PLA.
Până în 1950, PLA a terorizat și a ucis proprietarii de terenuri înstăriți în întreaga Luzon, mulți dintre ei având legături de familie sau de prietenie cu oficialii guvernamentali din Manila. Deoarece PLA era un grup de stânga, deși nu era afiliat îndeaproape cu Partidul Comunist Filipin, Statele Unite au oferit consilieri militari să ajute guvernul filipinez în combaterea gherilelor. Acest lucru a fost în timpul Războiului din Coreea, așa că îngrijorarea americană cu privire la ceea ce ulterior va fi denumit „Efectul Domino” a asigurat o cooperare dornică a SUA în operațiuni anti-PLA.
Ceea ce a urmat a fost literalmente o campanie anti-insurgență în manual, întrucât armata filipineză a folosit infiltrarea, dezinformarea și propaganda pentru a slăbi și confunda PLA. Într-un caz, două unități PLA s-au convins fiecare că cealaltă a fost de fapt parte a armatei filipineze, așa că au avut o luptă de foc prietenos și au provocat victime grele.
În 1954, Luis Taruc s-a predat. Ca parte a negocierii, el a fost de acord să execute o pedeapsă de cincisprezece ani de închisoare. Negociatorul guvernamental care l-a convins să renunțe la luptă a fost un tânăr senator carismatic numit Benigno "Ninoy" Aquino Jr.