Se crede că cei mai vechi strămoși umani provin din continentul Africii. Pe măsură ce primatele s-au adaptat și apoi s-au ramificat în multe specii diferite de pe arborele vieții, a apărut linia care a devenit în cele din urmă ființele noastre umane moderne. Deoarece ecuatorul taie direct pe continentul Africii, țările de acolo primesc aproape direct lumina soarelui tot anul. Această lumină directă a soarelui, cu raze ultraviolete și temperaturile calde aduce presiune pentru selecția naturală a culorii închise a pielii. Pigmenții, precum melanina din piele, protejează împotriva acestor raze dăunătoare ale soarelui. Acest lucru a menținut persoanele cu pielea întunecată în viață mai mult timp și ar reproduce și transmite genele cu pielea întunecată la urmașii lor.
Principala genă care controlează culoarea ochilor este relativ strâns legată de genele care provoacă culoarea pielii. Se crede că strămoșii umani antici aveau ochi de culoare maro închis sau aproape negru și păr foarte întunecat (care este controlat și de gene legate de culoarea ochilor și culoarea pielii). Chiar dacă ochii căprui sunt în continuare considerați mai ales în general culori dominante ale ochilor, există mai multe culori diferite ale ochilor ușor văzute acum în populația globală de ființe umane. Deci, de unde au venit toate aceste culori pentru ochi?
În timp ce încă se colectează dovezi, majoritatea oamenilor de știință sunt de acord că selecția naturală pentru culorile mai deschise ale ochilor este legată de relaxarea selecției pentru tonurile mai închise ale pielii. Pe măsură ce strămoșii umani au început să migreze în diverse locuri din lume, presiunea pentru selectarea culorii închise a pielii nu a fost la fel de intensă. Deosebit de inutil pentru strămoșii umani care s-au stabilit în ceea ce sunt acum națiunile vest-europene, selecția pentru pielea închisă și ochii întunecați nu mai era necesară pentru supraviețuire. Aceste latitudini mult mai mari permiteau diferite anotimpuri și nu exista lumina soarelui direct ca aproape de ecuatorul de pe continentul Africii. Deoarece presiunea de selecție nu mai era la fel de intensă, genele aveau mai multe șanse de mutare.
Culoarea ochilor este un pic complexă când vorbim de genetică. Culoarea ochilor umani nu este dictată de o singură genă ca multe dintre celelalte trăsături. În schimb, este considerată o trăsătură poligenică, ceea ce înseamnă că există mai multe gene diferite pe diverși cromozomi care poartă informații despre ce culoare a ochilor ar trebui să posede un individ. Aceste gene, atunci când sunt exprimate, apoi se amestecă pentru a face diverse nuanțe de culori diferite. Selecția relaxată pentru culoarea ochilor întunecați a permis, de asemenea, mai multe mutații să prindă. Acest lucru a creat și mai multe alele disponibile pentru a se combina împreună în bazinul de gene pentru a crea culori de ochi diferite.
Persoanele care își pot urmări strămoșii în țările Europei Occidentale au, în general, o culoare mai deschisă a pielii și o culoare mai deschisă a ochilor decât cele din alte părți ale lumii. Unii dintre acești indivizi au arătat, de asemenea, părți ale ADN-ului lor care erau foarte asemănătoare cu cele ale lungimii neandertale. S-a crezut că neanderthalienii au culori de păr și ochi mai deschise decât ale lor Homo sapien veri.
Noile culori ale ochilor ar putea continua să evolueze pe măsură ce mutațiile se acumulează în timp. De asemenea, pe măsură ce indivizii cu diverse nuanțe de culori ale ochilor se reproduc între ei, amestecarea acelor trăsături poligene poate duce, de asemenea, la apariția de noi nuanțe de culoare a ochilor. Selecția sexuală poate explica, de asemenea, unele dintre diferitele culori ale ochilor care au apărut de-a lungul timpului. Împerecherea, la om, tinde să fie non-aleatoare și ca specie, suntem capabili să ne alegem împerecheții pe baza unor caracteristici dezirabile. Unele persoane pot găsi o culoare a ochilor mult mai atrăgătoare față de alta și pot alege o pereche cu acea culoare a ochilor. Apoi, acele gene sunt transmise descendenților lor și continuă să fie disponibile în bazinul de gene.