Rebeliunea Shimabara a fost o revoltă țărănească împotriva Matsukura Katsuie din Domeniul Shimabara și Terasawa Katataka din Domeniul Karatsu.
Luptată între 17 decembrie 1637 și 15 aprilie 1638, Rebeliunea Shimabara a durat patru luni.
Rebelii Shimabara
Tokugawa Shogunate
Inițial pământurile familiei creștine Arima, Peninsula Shimabara a fost dăruită clanului Matsukura în 1614. Ca urmare a apartenenței religioase a fostului lor domn, mulți dintre locuitorii din peninsulă au fost și creștini. Primul dintre noii domnii, Matsukura Shigemasa, a căutat avansarea în rândurile Shogunatei Tokugawa și a ajutat la construirea Castelului Edo și la o invazie planificată a Filipinelor. El a urmărit, de asemenea, o politică strictă de persecuție împotriva creștinilor locali.
În timp ce creștinii au fost persecutați în alte zone ale Japoniei, gradul de represiune a lui Matsukura a fost considerat deosebit de extrem de străini, cum ar fi comercianții locali olandezi. După ce a preluat noile sale pământuri, Matsukura a construit un nou castel la Shimabara și a văzut că vechiul scaun al clanului Arima, Castelul Hara, a fost demontat. Pentru a finanța aceste proiecte, Matsukura a impus impozite grele asupra poporului său. Aceste politici au fost continuate de fiul său, Matsukura Katsuie. O situație similară s-a dezvoltat pe Insulele Amakusa adiacente, unde familia Konishi fusese strămutată în favoarea Terasawas.
În toamna anului 1637, populația nemulțumită, precum și samuraiul local, fără stăpân, au început să se întâlnească în secret pentru a planifica o răscoală. Aceasta a izbucnit în Shimabara și în Insulele Amakusa pe 17 decembrie, în urma asasinării daikanului (funcționar fiscal) Hayashi Hyôzaemon. În primele zile ale revoltei, guvernatorul regiunii și mai mult de treizeci de nobili au fost uciși. Rândurile rebeliunii s-au umflat rapid, în timp ce toți cei care locuiau în Shimabara și Amakusa au fost nevoiți să se alăture rândurilor armatei rebele. Carismaticul Amakusa Shiro, în vârstă de 14/16 ani, a fost selectat pentru a conduce rebeliunea.
În efortul de a smulge revolta, guvernatorul Nagasaki, Terazawa Katataka, a expediat o forță de 3.000 de samurai către Shimabara. Această forță a fost învinsă de rebeli la 27 decembrie 1637, guvernatorul pierzând pe toți, în afară de 200 de oameni. Luând inițiativa, rebelii au asediat castelele clanului Terazawa la Tomioka și Hondo. Acestea s-au dovedit nereușite, deoarece au fost forțați să renunțe la ambele asedii în fața înaintării armatelor shogunate. Traversând Marea Ariake spre Shimabara, armata rebelă a asediat castelul Shimabara, dar nu au putut să o ia.
Retrăgându-se spre ruinele Castelului Hara, au re-fortificat situl folosind lemnul luat de pe corăbii lor. Furnizând Hara cu mâncare și muniție confiscată din depozitele lui Matsukura din Shimabara, cei 27.000-37.000 de rebeli pregătiți să primească armatele shogunate care soseau în zonă. Condusă de Itakura Shigemasa, forțele shogunate au asediat castelul Hara în ianuarie 1638. Cercetând situația, Itakura a solicitat ajutorul olandezilor. Ca răspuns, Nicolas Koekebakker, șeful secției de tranzacționare de la Hirado, a trimis praf de pușcă și tun.
Ulterior, Itakura a cerut ca Koekebakker să trimită o navă să bombardeze litoralul din Castelul Hara. Sosind de Ryp (20), Koekebakker și Itakura au început un bombardament ineficient de 15 zile asupra poziției rebele. După ce a fost păcălit de rebeli, Itakura a trimis de Ryp înapoi la Hirado. Ulterior a fost ucis într-un atac eșuat asupra castelului și înlocuit de Matsudaira Nobutsuna. În căutarea redobândirii inițiativei, rebelii au lansat un atac de noapte major pe 3 februarie, care a ucis 2.000 de soldați din Hizen. În ciuda acestei victorii minore, situația rebelilor s-a agravat pe măsură ce dispozițiile au scăzut și au sosit mai multe trupe shogunate.
Până în aprilie, cei 27.000 de rebeli rămași se confruntau cu peste 125.000 de războinici shogunate. Cu puțină alegere, au încercat o pauză la 4 aprilie, dar nu au putut să treacă prin liniile lui Matsudaira. Prizonierii luați în timpul bătăliei au dezvăluit că mâncarea și muniția rebelului erau aproape epuizate. Mergând mai departe, trupele shogunate au atacat pe 12 aprilie și au reușit să ia defensele exterioare ale lui Hara. Împins, au reușit în sfârșit să ia castelul și să pună capăt rebeliunii trei zile mai târziu.
Luând castelul, trupele shogunate au executat pe toți acei rebeli care erau încă în viață. Aceasta împreună cu cei care s-au sinucis înainte de căderea castelului, a însemnat că întreaga garnizoană de 27.000 de bărbați (bărbați, femei și copii) a murit ca urmare a bătăliei. Toate spus, aproximativ 37.000 de rebeli și simpatizanți au fost uciși. În calitate de lider al rebeliunii, Amakusa Shiro a fost decapitată, iar capul a fost dus înapoi la Nagasaki pentru afișare.
Întrucât Peninsula Shimabara și Insulele Amakusa au fost în esență depopulate de rebeliune, noi imigranți au fost aduși din alte părți ale Japoniei și țările împărțite între un nou set de domnii. Ignorând rolul pe care supra-impozitarea l-a jucat în provocarea revoltei, shogunatul a ales să-i dea vina pe creștini. Interzicând oficial credința, creștinii japonezi au fost forțați în subteran unde au rămas până în secolul al XIX-lea. În plus, Japonia s-a închis în lumea exterioară, lăsând doar câțiva comercianți olandezi să rămână.