După ce au încheiat Conferința de la Yalta din februarie 1945, liderii aliați „Cei trei mari”, Franklin Roosevelt (Statele Unite), Winston Churchill (Marea Britanie) și Joseph Stalin (URSS) au convenit să se întâlnească din nou în urma victoriei din Europa pentru a determina granițele postbelice, negocia tratatele și soluționează problemele referitoare la gestionarea Germaniei. Această întâlnire planificată urma să fie a treia lor adunare, prima fiind Conferința din Teheran din noiembrie 1943. Odată cu predarea germană pe 8 mai, liderii au programat o conferință în orașul german Potsdam pentru iulie.
Pe 12 aprilie, Roosevelt a murit, iar vicepreședintele Harry S. Truman a urcat la președinție. Deși relativ neofit în afacerile externe, Truman era mult mai suspicios în ceea ce privește motivele și dorințele lui Stalin în Europa de Est decât predecesorul său. Plecând spre Potsdam împreună cu secretarul de stat James Byrnes, Truman spera să înlocuiască unele concesii pe care Roosevelt le-a acordat-o lui Stalin în numele menținerii unității aliate în timpul războiului. Întâlnind la Schloss Cecilienhof, discuțiile au început pe 17 iulie. Prezidând conferința, Truman a fost inițial sprijinit de experiența lui Churchill în relația cu Stalin.
Aceasta s-a oprit brusc la 26 iulie, când Partidul Conservator Churchill a fost înfrânt uimitor la alegerile generale din 1945. Ținut la 5 iulie, anunțul rezultatelor a fost întârziat pentru a număra cu exactitate voturile venite de la forțele britanice care slujesc în străinătate. Odată cu înfrângerea lui Churchill, liderul de război al Marii Britanii a fost înlocuit de prim-ministrul Clement Attlee și de noul secretar de externe, Ernest Bevin. Lipsând experiența vastă și spiritul independent al lui Churchill, Attlee a adus frecvent lui Truman în ultimele etape ale discuțiilor.
Când a început conferința, Truman a aflat de Testul Trinității din New Mexico, ceea ce a semnalat finalizarea cu succes a Proiectului Manhattan și crearea primei bombe atomice. Împărtășind aceste informații cu Stalin pe 24 iulie, el spera că existența noii arme îi va întări mâna în relația cu liderul sovietic. Acest nou lucru nu a reușit să-l impresioneze pe Stalin în timp ce aflase despre Proiectul Manhattan prin intermediul rețelei sale de spionaj și era conștient de progresul său.
Pe măsură ce începeau discuțiile, liderii au confirmat că atât Germania, cât și Austria vor fi împărțite în patru zone de ocupație. Presând mai departe, Truman a căutat să diminueze cererea Uniunii Sovietice de reparații grele din partea Germaniei. Considerând că reparațiile severe percepute de Tratatul de la Versailles după primul război mondial au stricat economia germană care a condus la ascensiunea naziștilor, Truman a lucrat pentru a limita reparațiile de război. După negocieri ample, s-a convenit că reparațiile sovietice vor fi limitate la zona lor de ocupație, precum și la 10% din capacitatea industrială excedentă a celeilalte zone..
Liderii au convenit, de asemenea, că Germania trebuie demilitarizată, identificată și că toți criminalii de război ar trebui urmăriți penal. Pentru a realiza prima dintre acestea, industriile asociate cu crearea de materiale de război au fost eliminate sau reduse odată cu noua economie germană pentru a se baza pe agricultură și fabricație internă. Printre deciziile controversate care trebuiau luate la Potsdam se numărau cele din Polonia. În cadrul discuțiilor de la Potsdam, SUA și Marea Britanie au fost de acord să recunoască Guvernul provizoriu de unitate națională susținut de sovietici, mai degrabă decât guvernul polonez în exil, cu sediul la Londra din 1939.
În plus, Truman a acceptat cu reticență să adere la cerințele sovietice ca noua frontieră vestică a Poloniei să se întindă de-a lungul liniei Oder-Neisse. Utilizarea acestor râuri pentru a denota noua frontieră a văzut că Germania pierde aproape un sfert din teritoriul său prebelic, cu cea mai mare parte în Polonia și o mare parte a Prusiei de Est în fața sovieticilor. Deși Bevin a argumentat împotriva liniei Oder-Neisse, Truman a tranzacționat efectiv acest teritoriu pentru a obține concesii în problema reparațiilor. Transferul acestui teritoriu a dus la deplasarea unui număr mare de etnici germani și a rămas controversat zeci de ani.
Pe lângă aceste aspecte, Conferința de la Potsdam a văzut aliații să fie de acord cu formarea unui Consiliu de miniștri de externe care să pregătească tratate de pace cu foștii aliați ai Germaniei. Liderii aliați au convenit, de asemenea, să revizuiască Convenția de la Montreux din 1936, care oferea Turciei controlul exclusiv asupra strâmtorilor turcești, că SUA și Marea Britanie vor determina guvernul Austriei și că Austria nu va plăti reparații. Rezultatele Conferinței de la Potsdam au fost prezentate în mod oficial în Acordul de la Potsdam, care a fost emis la sfârșitul reuniunii la 2 august.
Pe 26 iulie, în timp ce se afla la Conferința de la Potsdam, Churchill, Truman și liderul chinez naționalist Chiang Kai-Shek au emis Declarația de la Potsdam, care expunea condițiile de predare pentru Japonia. Reiterând apelul la predarea necondiționată, Declarația prevedea că suveranitatea japoneză trebuia limitată la insulele de origine, criminalii de război vor fi urmăriți, guvernul autoritar urma să se încheie, armata va fi dezarmată și că va urma o ocupație. În ciuda acestor termeni, a subliniat, de asemenea, că Aliații nu au căutat să distrugă japonezii ca popor.
Japonia a refuzat acești termeni în ciuda unei amenințări aliate că ar urma „distrugerea promptă și completă”. Reacționând, către japonezi, Truman a ordonat folosirea bombei atomice. Utilizarea noii arme pe Hiroshima (6 august) și Nagasaki (9 august) a condus în cele din urmă la predarea Japoniei la 2 septembrie. Plecând din Potsdam, liderii aliați nu se vor mai întâlni. Înghețarea relațiilor SUA-sovietice care a început în timpul conferinței a escaladat în cele din urmă în Războiul Rece.