Timp de câteva secole, s-a crezut că organismele vii pot proveni în mod spontan din materie fără viață. Această idee, cunoscută drept generație spontană, este cunoscută acum ca fiind falsă. Proponenții cel puțin a unor aspecte ale generației spontane au inclus filozofi și oameni de știință bine respectați, precum Aristotel, Rene Descartes, William Harvey și Isaac Newton. Generația spontană a fost o noțiune populară datorită faptului că părea să fie în concordanță cu observațiile conform cărora o serie de organisme animale ar apărea din surse fără vii. Generarea spontană a fost respinsă prin efectuarea mai multor experimente științifice semnificative.
Înainte de jumătatea secolului al XIX-lea, se credea în mod obișnuit că originea anumitor animale provenea din surse fără vie. Păduchii se credeau că provin din murdărie sau transpirație. Se credea că viermii, salamandrele și broaștele sunt născute din noroi. Maggots-urile erau derivate din putrezirea cărnii, afidelor și gândacilor, care se presupune că au apărut din grâu, iar șoarecii au fost generați din haine murdare amestecate cu boabe de grâu. În timp ce aceste teorii par destul de ludice, la acea vreme s-a crezut că sunt explicații rezonabile pentru modul în care anumite bug-uri și alte animale păreau să nu apară din nicio altă materie vie.
În timp ce o teorie populară de-a lungul istoriei, generația spontană nu a fost lipsită de critici. Mai mulți oameni de știință și-au propus să infirme această teorie prin experimentare științifică. În același timp, alți oameni de știință au încercat să găsească dovezi în sprijinul generației spontane. Această dezbatere ar dura câteva secole.
În 1668, omul de știință și medicul italian Francesco Redi și-a propus să respingă ipoteza conform căreia vrăjitorii erau generați spontan din putrezirea cărnii. El a susținut că vrăjitorii au fost rezultatul muștelor care depun ouă pe carne expusă. În experimentul său, Redi a plasat carnea în mai multe borcane. Unele borcane au fost lăsate neacoperite, altele au fost acoperite cu tifon, iar altele au fost sigilate cu un capac. De-a lungul timpului, carnea din borcanele neacoperite și borcanele acoperite cu tifon au devenit infestate cu maggots. Cu toate acestea, carnea din borcanele sigilate nu avea viermi. Întrucât numai carnea care era accesibilă la muște avea maggots, Redi a ajuns la concluzia că maggots-urile nu apar spontan din carne.
În 1745, biologul și preotul englez John Needham și-au propus să demonstreze că microbii, precum bacteriile, au fost rezultatul generarii spontane. Datorită invenției microscopului din anii 1600 și îmbunătățirii utilizării acestuia, oamenii de știință au putut vedea organisme microscopice precum ciuperci, bacterii și protisti. În experimentul său, Needham a încălzit bulionul de pui într-un balon pentru a ucide orice organism viu în bulion. El a lăsat bulionul să se răcească și l-a așezat într-un balon sigilat. Needham a plasat și bulionul neîncălzit într-un alt recipient. De-a lungul timpului, atât bulionul încălzit, cât și bulionul neîncălzit au conținut microbi. Needham era convins că experimentul său a dovedit generarea spontană în microbi.
În 1765, biologul și preotul italian Lazzaro Spallanzani au început să demonstreze că microbii nu se generează spontan. El a susținut că microbii sunt capabili să se miște prin aer. Spallanzani credea că microbii au apărut în experimentul lui Needham, deoarece bulionul a fost expus la aer după fierbere, dar înainte de a fi sigilat. Spallanzani a conceput un experiment în care a introdus bulionul într-un balon, a sigilat balonul și a scos aerul din balon înainte de a fierbe. Rezultatele experimentului său au arătat că niciun microb nu a apărut în bulion atât timp cât a rămas în starea sa sigilată. În timp ce se părea că rezultatele acestui experiment au creat o lovitură devastatoare pentru ideea generarii spontane în microbi, Needham a argumentat că eliminarea aerului din balon a făcut imposibilă generarea spontană.
În 1861, Louis Pasteur a prezentat dovezi care ar pune aproape capăt dezbaterii. El a proiectat un experiment similar cu cel al lui Spallanzani, cu toate acestea, experimentul lui Pasteur a implementat o modalitate de a filtra microorganismele. Pasteur a folosit un balon cu un tub lung, curbat, numit balon cu gât de lebădă. Acest balon a permis aerului să aibă acces la bulionul încălzit în timp ce prinde praful care conține spori bacterieni în gâtul curb al tubului. Rezultatele acestui experiment au fost că nu au crescut microbi în bulion. Când Pasteur a înclinat balonul pe partea sa, permițând accesul bulionului la gâtul curb al tubului și apoi a pus din nou balonul în poziție verticală, bulionul a fost contaminat și bacteriile s-au reprodus în bulion. Bacteriile au apărut, de asemenea, în bulion, dacă balonul era rupt lângă gât, permițând bulionului să fie expus la aerul nefiltrat. Acest experiment a demonstrat că bacteriile care apar în bulion nu sunt rezultatul generarii spontane. Majoritatea comunității științifice a considerat această dovadă concludentă împotriva generarii spontane și a dovezii că organismele vii apar doar din organismele vii.