Situl peșterii Shanidar este situat în vecinătatea satului modern Zawi Chemi Shanidar din nordul Irakului kurdu, pe râul Zab din Munții Zagros, unul dintre afluenții principali ai râului Tigris. Între 1953 și 1960, resturile scheletice ale nouă neandertali au fost recuperate din peșteră, făcându-l unul dintre cele mai importante situri neandertale din vestul Asiei la acea vreme..
Peștera Shanidar măsoară în jur de 13.000 de metri pătrați (1.200 de metri pătrați) în suprafață, sau 53x53 de metri pătrați (53x53 m). Gura peșterii măsoară astăzi aproximativ 25 m lățime și aproximativ 26 m înălțime. Depozitele sitului au o grosime de aproximativ 14 m, pe care excavatorul Ralph Solecki a împărțit-o în patru straturi culturale majore, fiecare separat de ceea ce echipa lui Solecki a recunoscut ca discontinuități discrete.
Cele mai scăzute, mai vechi și mai substanțiale niveluri de la Shanidar sunt nivelurile Mousteriene, care reprezintă o perioadă de timp în care neanderthalii au trăit acolo cu aproximativ 50.000 de ani în urmă. În cadrul acestor depozite au fost descoperite nouă îngropări umane, dintre care cel puțin unele au fost înmormântări deliberate.
Toate cele nouă înmormântări de la Shanidar au fost găsite sub o cascadă de peșteră, dar excavatoarele erau absolut sigure că cel puțin o parte din înmormântări au fost destinate. În anii 1960, aceasta a fost o declarație șocantă de făcut, deoarece neanderthalii nu erau considerați oameni, cu siguranță nu se credea capabili să aibă grijă de morții lor. De atunci, au fost recuperate, în mod obișnuit, mai multe dovezi pentru îngropările paleoliticului mijlociu în alte situri de peșteri - la peșterile Qafzeh, Amud și Kebara (toate în Israel), Saint-Cesaire (Franța) și Dederiyeh (Siria).
Unele dintre scheletele de la Shanidar prezintă dovezi pentru violență interpersonală în rândul vânătorilor și culegătorilor de pleistoceni, un nivel de violență atestat și la El Sidrón, în Spania. Shanidar 3, un schelet masculin adult bine conservat, a suferit o vătămare parțial vindecată la o coastă. Se consideră că această vătămare a fost cauzată de traumatisme cu forță ascuțită dintr-un punct de piatră sau o lamă. Acesta este unul dintre doar câteva exemple cunoscute de leziuni traumatice ale neandertalienilor cauzate de un instrument de piatră, altele includ St. Cesaire în Franța și Peștera Skhul din Israel. Investigațiile arheologice experimentale realizate de arheologul american Steven Churchill și colegii sugerează că această vătămare a rezultat din împușcarea unei arme cu proiectile de rază lungă.
Scheletul cunoscut sub numele de Shanidar 1 a fost un bărbat adult mai în vârstă, care a supraviețuit unei fracturi zdrobitoare la soclul ochiului stâng și pierderea antebrațului și a mâinii drepte. Arheologii Erik Trinkaus și Sebastien Villotte consideră că acest individ era și el surd, bazat pe prezența creșterilor osoase la urechi. Nu numai că aceste schelete prezintă dovezi interpersonale, dar indică și faptul că neanderthalii au avut grijă de persoane care au fost handicapate.
Shanidar a fost în centrul primelor studii analitice florale, care au prezentat ceea ce a devenit o interpretare controversată. Probele de sol prelevate din sedimentele din apropierea înmormântărilor au conținut o abundență de polen din mai multe tipuri de flori, inclusiv ephedra modernă din plante. Abundența de polen a fost interpretată de Solecki și de cercetătorul coleg Arlette Leroi-Gourhan ca dovadă că florile au fost îngropate cu cadavrele. Cu toate acestea, există unele dezbateri cu privire la sursa polenului, cu unele dovezi potrivit cărora rămășițele plantei ar fi putut fi aduse pe șantier prin rozătoare, mai degrabă decât plasate acolo ca flori de rude îndurerate. Studiile recente ale palinologilor Marta Fiacconi și Chris Hunt sugerează, de asemenea, că polenul găsit în peșteră nu este diferit de polenul găsit în afara peșterii.
Studiile microscopice ale depunerilor de calcul - cunoscute și sub denumirea de tartru - pe dinți de la neanderthalii de la Shanidar au găsit resturi vegetale ale mai multor alimente amidonice care au constituit dieta locuitorilor. Aceste plante includ semințe de iarbă, curmale, tuberculi și leguminoase. Unele dovezi sugerează că cel puțin o parte din plantele consumate au fost gătite, iar pe fețele unora dintre uneltele Mousteriene din peșteră s-au găsit și boabe de amidon conservate din orz sălbatic.
Săpăturile originale au fost efectuate în peșteră în anii 1950, dirijați de arheologul american Ralph S. Solecki. Ulterior, Trinkaus a efectuat investigații ulterioare despre sit și pe artefacte și probe de sol recuperate de pe site. Pe plan local, Shanidar a fost locuită până de curând de ciobanii kurzi, dar acum este administrată de serviciul local de antichități și a devenit o destinație turistică populară kurdă..